In the Glow of Darkness

Hikaye, Ghost in the Shell: S.A.C.'deki olaylardan iki yıl sonra, 2034 yılında geçiyor. 2. konser Kadın cyborg Binbaşı Motoko Kusanagi, siber savaşta uzmanlaşmış seçkin bir terörle mücadele ve suçla mücadele birimi olan ve Togusa'nın saha lideri olarak görev yaptığı 20 saha ajanından oluşan bir ekibe genişleyen Kamu Güvenliği Bölüm 9'dan ayrıldı.

Yıl 2030 ve yalnızca "Gülen Adam" olarak bilinen bir suçlunun, siber terörizm, adam kaçırma ve casusluk eylemleri gerçekleştirerek önde gelen tıbbi nanoteknoloji firmalarını hiçbir bilinen şüpheli bırakmadan süpürmesinin üzerinden altı yıl geçti. Bölüm 9, Stand Alone Complex içeriğinin bu derlemesinde akıl almaz eylemlerde bulunabilen bir şüphelinin peşine düşerken yeni bilgiler ortaya çıkıyor.