Bionic Ninja

Yıllar önce bir grup ninja, Mouryou adlı şeytanın gücünü kullanarak bütün dünyayı fethetmeye çalışmışlar ancak başarısız olmuşlardır. Mouryou'nun bedeni ve ruhu iki farklı tapınağa mühürlenmiştir. Ancak Yomi, Mouryou'yu tekrar dünyaya çağırır ve bedenine kavuşana kadar kendi bedenini onun hizmetine sunar. Çok geçmeden başlayan savaşta Tsunade, Naruto'ya Shinon adlı rahibeyi koruma görevi verir. Üstelik bu görevde Sakura ve Lee ile birlikte Neiji'nin himayesinde olacaktır. Önemsiz gibi görünen bu görev aslında bütün savaşın kilit noktasıdır. Çünkü sadece rahibeler mühürleme yapabilmektedir ve Shinon geriye kalan tek rahibedir. Mouryou kendi bedenine kavuşmadan mühürleme işlemi yapılmak zorundadır ancak bu hiçte kolay olmayacaktır.

Güneyde, hilal şeklindeki bir adada bulunan Ay ülkesi (Moon Country), çok zengin ve varlıklı bir ülkedir. Bu zengin ülkenin Prensi olan Michiru bugüne kadar her istediğini para ile satın almıştır. Bu zengin prens son olarak bir seyahate çıkmaya karar verir. Prens Michiru ve oğlu Hikaru’yu koruma görevi ise kahramanlarımıza yani Naruto, Sakura, Kakashi ve Lee’ye verilir.

Dünyanın en ölümcül suikastçilerinden olan Raizo’yu konu alıyor. Raizo, çocukken varlığı bile bir söylence olarak kabul edilen gizli örgüt Ozunu Klanı tarafından sokaklardan alınıp bir ölüm makinesi olmak üzere eğitilmiştir. Arkadaşının klan tarafından acımasızca öldürülmesini bir türlü unutamayan Raizo, örgütten kaçar ve ortadan kaybolur. Şimdi intikamını almak için hazırlık yaparak beklemektedir. Berlin’de APT ajanı olan Mika Coretti, birçok siyasi cinayeti Uzak Doğu’daki bir yeraltı örgütüne bağlayan yüklü bir para davasıyla karşılaşır. Amiri Ryan Maslow’un emirlerini hiçe sayan Mika, cinayetlerin ardındaki gerçeği öğrenmek için çok gizli dosyaları karıştırmaya başlar. Araştırmaları, onu hedef hâline getirir ve Ozunu Klanı onu öldürüp sonsuza dek susturması için Takeshi’nin liderliğinde bir suikast ekibi gönderir.

İkinci Ninja Savaşı sırasında Konoha tarafından yok edilen Gökyüzü Ülkesi'nin hayatta kalan üyeleri uzun zaman sonra güçlerini arttırarak Konoha'ya saldırılar. O sırada orada bulunan gizemli doktor Shinou sayesinde birçok yaralı ölümden kurtulur. Ancak Shinou'nun öğrencisi Amaru'nun köyü tehlikededir. Bu yüzden Tsunade; Naruto'nun, Sasuke'nin ve Hitana'nın doktor ile Amaru'ya eşlik etmelerini ister. Köye vardıklarında köyün harabeye döndüğünü görürler. Bu sırada gerçekleşen saldırı sırasında Shinoui, Amaru'yu kurtarmak için önüne atlar ve vücuduna saplanan kunailer yüzünden can verir. Ancak kısa zaman sonra bunun bir oyun olduğu ortaya çıkar. Shinou gerçekte kimdir ve ne istemektedir?